HDR Donor 技术解析与应用
一、定义与核心功能
HDR(同源定向修复)Donor 是CRISPR基因编辑中用于精确敲入(Knock-in)的供体模板,通过同源重组机制修复DNA双链断裂(DSB),实现目标基因的定点插入或修饰。其核心功能包括:
- 精准编辑:供体模板与基因组靶位点两端具有高同源性(通常≥200 bp),确保修复的准确性。
- 多样化修饰:支持基因敲除、突变引入、标签融合(如荧光蛋白、筛选标记)等应用。
二、产品类型与技术参数
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供体载体(Donor Vector)
- 结构:包含同源臂、筛选标记(如抗生素抗性基因)及目标序列,需通过慢病毒或质粒递送至细胞。
- 服务周期:定制化构建需5-7周,覆盖人、小鼠等多种物种基因。
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合成寡核苷酸(Donor Oligos/Blocks)
- Alt-R HDR Donor Blocks:双链DNA片段,长度可达3000 bp,经化学修饰降低非特异性整合风险(如钝端插入),提升HDR效率。
- 优势:支持大片段插入(如GFP标签),NGS验证序列准确性,与HDR Enhancer联用可进一步提升成功率。
三、核心优势对比
类型 |
优势 |
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供体载体 |
支持复杂修饰(如多基因插入),兼容稳定细胞系筛选 |
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Alt-R Donor Blocks |
高纯度、低脱靶、长片段编辑(≤3 kb),缩短实验周期 |
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四、应用场景
- 基础研究:
- 基因功能验证(如启动子活性分析)。
- 疾病模型构建(如肿瘤相关突变敲入)。
- 生物技术开发:
- CAR-T细胞改造(插入特定受体基因)。
- 作物抗逆基因编辑(大片段抗病基因整合)。
五、实验优化建议
- 提高HDR效率:
- 使用高活性Cas9变体(如HiFi Cas9),减少细胞毒性。
- 同步递送HDR Enhancer试剂(如IDT Alt-R HDR Enhancer V2),延长同源重组窗口期。
- 降低脱靶风险:选择化学修饰的Donor Blocks,抑制非同源末端连接(NHEJ)途径。